Take The Wave

by Naifu

2008.07.28

さて、今まで明示的にここで書かなかったですが、クマムシを飼っています。当然ですが、研究のためです。200匹から飼育を開始して、そして、ついにどうやら第一次目標数に到達したようです。

まぁ、ただしクマムシの飼育はかなり大変で、あまりにも時間と労力をとられすぎていろんなことに余裕がなくなってしまっている。さすがにまずいので、目標数にも到達したことだし、ドラスティックに最適化をしていこう。Bioinformaticsの、しかもDeveloper属性が強いタイプの人間なので、最適化に関してはとにかく自信はある。ただし、いろいろなものを犠牲にしてきていると思うので、ある程度立て直しは急務だ。一応コマはたぶん揃っていて、機材の到着を待てば今の３、４倍の効率にはなるはず。嬉しいのは、母体数はこれ以上変化させないため、これからの最適化は全て完全にそのまま結果に反映される。

車の修理に予想以上のお金がかかることが判明。時間・仕事・お金、どれにも余裕がない状態。こういう時は自分の余裕の無さ故に簡単にいろいろなものに悪影響を与えてしまうから要注意。っていうか、明らかに波及しつつあるんだが、、、。

髪を切ると生まれつきの童顔が強調されて、かなり若返った印象を与えるみたいだ。高校生の時にはやはり早く大人になりたくて、中学生に見られるのが嫌でやたらと髪を長くしていたけれど、三十路目前の最近はこんなgenotypeも悪くないと思う。が、ゼミの後輩に高校生かと思った、とか言われるのはまだからかっているのだと思っていたが、スーパーでビール（よなよなエール）を買おうとしたら「失礼ですが、成人していらっしゃいますか？」と聞かれる始末。最初何を言っているのかわからなくて聞き返してしまった。「もうじき３０です」と言ったらやたらとビビられた＾＾；まぁしかし、事務や生協で学生に間違われるのはもう慣れたが、授業ではある程度上下関係が重要なので、今学期の全講義が終わってから髪を切ったのは正解。学生になめられたら教員やってられん。次の講義がはじまるまでにまた伸ばすか、、、。

ISMB三日目

2008.07.22

さて、基本的にBOSCが終わってしまうと、学会が終わった気になる（笑）というわけで、毎年ISMBはなんだか不思議な気分で参加するわけだが、たぶんその理由の一つがあまり発表が面白くないからだと思う。猛烈にたくさんパラレルセッションでやっているわりに、同一の時間帯にある発表がほとんど面白くないことも結構あり、やたらと内職が進む。でも１日に３個くらいはやたらと面白い発表に行き当たるから、収穫は少なくない。やたらと面白い発表にほとんど出会わない学会の方が多いし。

今年のOverton Prize Lectureは面白かった。僕は悪いクセで、面白い話を聴いていると頭がフル回転するので、だんだん聴いている話とは関係なく自分の研究に関してフル回転で考えるようになってしまい、いろんなアイデアが天から降ってくる＆猛烈にPubMed検索する＆OmniOutlinerファイルがデスクトップに散乱するのだけれど、結局気がつくと講演を聴いていなかったりする。というわけで、訂正すると、今年のOverton Prize Lectureの前半は少なくとも非常に面白かった。

Bio2RDF、すごいいい仕事をしている。２月から確実かつ素晴らしく進展している。これはGで正式採用しよう。ただ、そのためにいくつかステップが必要なので、コンタクトとってみるか。

いくつか共同研究を獲得。っていうか、はやく研究室に帰って研究したい。やっぱ俺研究たまらなく好きだわ。

プロポーズ大作戦、最終回結構殺人的だね、いろんな意味で。最後のカット、というか、本当に最後の最後の終わり方は好きなパターンなんだけど、なんかアレは、、、うーん、最初から最後まで殺人的なドラマだ。一応いい意味で。なんでトロントまで来てドラマ見てるかは秘密。

ISMB二日目

2008.07.20

トロントの地下鉄は、日曜日はなんと９時から動き始めるらしい。それを知らなかったものだから、雨に降られながらしばし途方にくれてしまった＾＾；すぐにタクシーを捕まえてClaire Fraserのキーノートには間に合った。チベット人タクシー運転手の兄ちゃん、なかなかナイスでした：）

今日からISMB。人が増えた＾＾；しかしそのせいでアメリカ人（というかカナダ人なんだろうけどあまり違わない）バカなので、途中で昼食がなくなってしまった（T−T）というわけで中途半端にしか昼飯食べられなくて、ただでさえ特にうまくもないテキトウな食事なのに余計ひもじい思いを。ISMBは開催場所によって食事と会場の質が違いすぎて酷い。だいたい飲み物がソーダしかないってどうよ。普通に水飲みたいんだが。やたらと甘くてデカいクッキーもいらんからパンを出せよ、まったく。

ISMBは基本的に１年以内の研究の結果をBioinformatics誌の臨時号に載せる論文として発表する場だ。だから例年どおり、通常の発表はほとんどがあまり面白くない。それを補うために、1年以内にPublishされた論文のHighlights Trackがあるんだが、当然こっちの方が断然面白いわけで、人も集まるのだけれど、会場が通常の発表の方が広くて、Highlight Trackの部屋は狭い。なんだかなぁ、もうちょっとなんとかならんものか。

Bioinformaticsはだいぶもう成熟していて、分野も広がりそれぞれが専門性を獲得してきている。当然共通の課題もあったりはするのだけれど、もうBioinformaticsのためのBioinformaticsではだめで、ちゃんと裏にBiologyが必要だ。まぁそんなの最初から当然そのはずなんだけど、成熟の結果余計にそれが顕著に思われる。だから発表とかポスターを見て回っても、頭を使っている（哲学が感じられる）仕事とそうでない仕事ではっきり面白さが二分されているように感じる。

iPhoneのA-GPSはカナダだと恐ろしく速いし精度が良い。どうやら携帯の基地局から場所を取得するのが良く出来ているようなのだが、ソフトバンクももうちょっとなんとかして欲しい。データ通信がなくても、普通にトロント市内のマップをキャッシュさせておけば市内で迷子になることはない。素晴らしい、もうiPhoneなしで見知らぬ土地にはいけなそうだ。

COULEUR CAFE

by Clementine

2008.07.19

徹夜で数万匹いるペットの世話をしつつデバッグし、少しだけ寝て成田へ。エアカナダは素晴らしすぎることに普通の電源があった！さらに電源用のUSBポートもあって、MacBook Proで開発しながらiPhoneを充電しつつ音楽を聴く。狭いエコノミークラスでもこの環境なら１４時間はある意味余裕だ。あとはWiFiが欲しいけど、下手にインターネットに繋がらない方がObjective-Cの開発ははかどる。Perlの場合はこうはいかないが。

トロントに到着後、まずはホテルに向かい、近所のスーパーで買い物。飲み物と食料を仕込んで、朝まで徹夜で開発＋プレゼン準備、と思ったが、さすがに睡魔に勝てず３時間だけ寝る。その後世を徹してスライドとブツを作り、なんとか発表できる段階でBOSCに直行。えーと、ここ数日で結局何時間寝れたんだろう＾＾；；；

BOSCはなんだかメンツが足りない。Jason, Hilmar, Paul、あとはMarkとPeterってところか。TomのかわりにJitenだったし、Martinも来ていない。っていうか、Darinがいないってどうよ＾；

僕のプレゼンは史上最悪の出来でした。聴いていた方々、大変申し訳ありません。深く反省しています。Nova通います(T-T)

さて、今回はReviewerをやって、なぜかChairmanまでやらされたBOSCだったが、全体的な感想としては、Bio*系は完全に面白くなくなっている。変わりにワークフロー系が幅を利かせて来ている。特筆すべき程面白いインタフェースなんかはないけれど、ergatisのように実用にたえるツールもできてきているし、ある程度のコンセンサスはできあがってきているようだ。特に象徴的なのが、ワークフローありきではなく、過程としてワークフローを記憶するというergatisやseahawkがとりつつアプローチ。結局科学研究のほとんどはヒューリスティックなプロセスであり、ワークフローがその結果としてでてくる僅かな部分であることは皆の同意が得られて来たということか。BioMobyが2.0でMobyCentralが管理するオントロジーをやめ、SparQLでRDFベースのオントロジーから検索するという大転換をしてみせたのも大きな進展だ。結局、そこは自立分散協調システムでいくしかない。

やはりBOSC/ISMBはホームグラウンドだと強く感じるし、刺激を受けてやる気がでるんだけど、それにしてもBOSC、やはり面白くはなくなってきているなぁ。もっと議論を中心にするようなミートにできるといいのだけれど。来年でBOSCは１０周年で、何かとプランを考えたいところだけれど、課題は多い。

夜はいまのところ大野さんらと食べにいったイタリアンと、ホテル近くのバーで食べたPhilly cheese steak!いやー、久しぶりに食べたけどやはりジャンキーで、最高。らーめんの次くらいに好きな食べ物：）

Visual Reflection in Science (room 803)でかなり頻繁にE-Cell 3Dのプロモが流れています。ISMB参加している皆さん、ご投票よろしくお願いしますm(_ _)m

Beat Lament The World

by Nujabes

2008.07.12

さて、最近まるでアニメばかり見ていると思われるかもしれないが、実際そうかもしれない＾＾；何気にCHANGEとかも見てますが。なんせキムタク首相論は、たぶん僕が世界で最初に言いはじめたことですし。（uketuguメーリングリストとかに記録があるはず。）

今日の話題はアンティーク 西洋骨董洋菓子店。ノイタミナの新作。ドラマを数年前に見たのでそのイメージかと思ったら、あれはきっとだいぶ原作からは違ってたんだなぁ。雰囲気は共通している気もするけど。初回からある意味強烈だが、しかしこれはこれで面白い。まず一番驚いたのが、橘圭一郎が、ハチクロの修ちゃんと同じ声！好きな声だし雰囲気あってるんだけど、なんだか最初は修ちゃんにしか聞こえなかった＾＾；

図書館戦争でも攻殻機動隊の使い回しとも思えるヘリや、人物まで3DCGで動かしても違和感がない見事なトゥーンシェーダなど、3DCGの使い方が興味深かったが、今回の3DCGの使い方も面白い。エンディングのアニメーションが端的にそのやり方を模式化しているが、違和感を多少感じながらもこれもありだなぁ、と思える。制作は全部違う場所だけれど、ノイタミナは一貫して技術力も高いなぁ。

Viva la Vida

by Coldplay

2008.07.11

さて、iPhone 3Gの感想といこうか。

通話。当たり前だが音声通話は普通に使える。ただし、多人数での通話は相手がiPhoneでなければ駄目な模様。電波は普通のソフトバンクの携帯よりも弱い。電池の持ちはiPod Touchよりもさすがに悪い。特にGPSが結構電力を消費する模様。YouTubeやSafariなどを使い続けながらたまにGPSを使い、音楽は常に聴いている状態だと持って４、５時間といったところか。

画面はTouchよりやや明るい。あと色温度が高め。Firmware 2.0は、ずっとiPod Touch 1.1.1をjailbreakで使っていたのでだいぶ違う。デフォルトでスクリーンショット（sleep/home同時押し）がとれたり、アイコンの配置が変えられたり。AppStoreも既にいいアプリがいくつかある。ただし、最低限ShellとVNCは欲しいのでJailbreakするかなぁ。

日本語入力は、テンキー入力がかなり使いやすい。ただし、予測変換がどうしてもたまに遅くなってしまうことが。

高速移動中（あるいは都内山手圏内のように無線スポットがありまくる場所での移動中）はWiFiをオンにしているとデータ通信が遅くなる傾向がある。HSDPAだけでも十分に速いので、移動中はWiFiを切っておくのが無難。

YouTubeはHSDPAの方がダウンロードが速い！と思ったら、そもそも提供されているデータ自体が違うようだ。WiFi時はiPod Touch同様h.264でかなり画質がいいが、HSDPAの時の画質はほとんどギリギリのレベル（人によっては荒すぎて許せないだろう）。まぁ、僕はiPhoneでYouTubeを使うときは音楽を聴きたいときなので、音質はかわらないからok。

スピーカーがついていることがiTouchと比べたときにかなりの違いを感じる。家ではゴロ寝しながら完全にハンズフリーで動画が見れる。スピーカフォンも便利だし、音量設定ボタンが本体についているのも素晴らしい。

GPSは非常に優秀。Google Mapはほぼカーナビのように使える。電車にのりながら移動するのをみるだけでも結構楽しい。実際、初めて行く場所にあらかじめピンをたててGPSをたよりに移動したが、ちゃんと迷わずつく事ができた。

カメラは期待していたよりだいぶ良い。どうやらiPhoneの画像補正と同じ事をやっているようで、ダイナミックレンジ補正が優秀。明るすぎる場所や暗い場所で特に効果を感じる。まぁ、マクロやズームはないが、携帯のカメラとしてはいいんじゃないだろうか。

さて、こんなかんじで基本的に印象はいいんだけど、デメリットもいくつか。まず、車で使っているTranspod Digitalで充電できなかった。iPod Touchと初代iPhoneでは使えたので、嫌がらせのようだ（涙）対応していないとご親切に表示されてしまう。音楽をFM Transmitすることはできるんだけど、それも電話機能がついていると同じFM波だからか干渉する。カーナビ＋カーオーディオ代わりにするにはmini-plug接続の何かを買わないとだめか。

また、携帯メールの使いどころが悪い。***@i.softbank.jpのアドレスがもらえ、IMAPメールなのでPCからも使えるが、保存期間が30日しかない。そして、僕がわからないだけかもしれないので知っている人がいたら是非教えて欲しいが、メール返信時に自動的に引用してしまう。これは特にメール受信の料金が高いDoCoMoユーザ相手には殺人的。さらに、僕は一日に受信するメールの件数（残念ながらSPAMも）が普通の人よりも非常に多いので、とにかく常にバイブが動いてしまう。かといってメールのバイブを切ると携帯メールの場合即時性が高いのでアウト。ソフトバンクユーザ相手ならSMSが使えるし、海外ではSMSがキャリア間でも送れて一般的なのだけれど、ガラパゴス日本はそうではない。というわけで、モバイルSuicaと携帯メールはしばらく普通の携帯を使う予定。メール送る相手が95%同一人物なので、スパボ一括で電話を変え与えようか、、、。自分で家族割り組めば電話も24時間無料だし。

まぁ何にしても、iPhoneは携帯電話ではない。忙しすぎて今は無理だけど、アプリをがんがん作っていきますよ：）

それにしても先週のゴルゴ、ついにゴルゴの台詞が一つもなかった（笑）館さん、それでいいのか＾＾；

速報

2008.07.11

気になっている皆様、無事iPhone 16G入手することになりました：）

あたしの街、明日の街

by 高橋瞳

2008.07.02

界王拳３倍でも足りない。でも俺の体力じゃ４倍は無理。ってことでプランBへ移行。それでも３倍界王拳は必要なんだから泣けてくる（T−T）

どんなに効率をあげても、週1.6倍のペースには敵わない。さすがに今週は俺が死にそう。週1.6倍って、すごいね。まぁでも、ムシごときに負ける俺の頭じゃないっすよ。一気に100倍になることができるんだ、できるはずなんだ、僕は頭を使うのが仕事なんだから。しっかし、増え過ぎ。いいことなんだけれど。そして、多分前人未到の域に到達：）

最後のマンガ展、リベンジで行ってきました！平日の昼なのに500mは並んでいた＾＾；しっかし、それでも行った甲斐があった。もう完全に圧巻の一言。今週末までしかやっていないけれど、バガボンドが好きなら、多分チケットもう手に入らないけど、なんとかして行った方がいい。「最後」ってそういうことだったのね。「マンガ」ってこういうことだったのね。ということが少なくともわかります。

余韻に浸りたくて、上野駅前のバルを見つけて、ビールとオリーブ盛り合わせでのんびり。こういう展示があって、こういう店があって、こういう入り方ができるのが少なくとも東京の良さだと思う。人が集まるというのは、少なくとも、大きな意味がある。

またReviewerの依頼がきた。最近一ヶ月に一つ以上くるようになって、なんだか少し一人前になれたようで嬉しい。Reviewer仕事をたくさんやるようになって、初めて論文リバイスの時の応対の仕方がわかってきた。しかし二週間以内って短いよ（T−T）

１時間半仮眠とろうと横になったら、夢の中で無数の卵拾ってた。起きだして緑茶を濃いめにいれたら、舞う茶葉がなんだかクロレラに見えて食欲を失った。

夢の中でデバッグして、物事の動きや人の行動が全部オブジェクトとインスタンスに見える朝は幸せだなぁ、と思った。やっぱバイオインフォやりたい。こうやって気づく愛もあるもんだ。とりあえず、投資した分は絶対に取り返すけど。

はぁ、なんだか病んでる今日のひとこと。